A medicina de peixes tropicais é usada para tratar doenças de peixes tropicais. As doenças dos peixes tropicais podem ser causadas por bactérias, fungos ou parasitas. Doenças de peixes tropicais comumente vistas são septicemia, doença do algodão, hidropisia, podridão das barbatanas, ictiofauna, infecção da bexiga natatória, olho estourado, buraco na cabeça, etc. A medicina de peixes tropicais inclui antibióticos, antifúngicos e antiparasitários.
Os medicamentos comumente usados para peixes tropicais são Sulfato de Kanamicina, Sulfato de Neomicina, Pimafix, Melafix, Contrast, Fungistop, Waterlife Cuprazin, Waterlife Myxazin, Waterlife Protozin, Waterlife Sterazin. As infecções parasitárias podem ser tratadas elevando a temperatura do tanque. A maioria dos peixes tropicais pode lidar facilmente com altas temperaturas. As bactérias que mais comumente afetam os peixes são Mycobacterium (TB), Streptococcus, Pseudonocardio, Staphylococcus, Cyanobacteria, bactérias nitrificantes.