As doenças dos peixes tropicais podem ser causadas por bactérias, fungos ou parasitas. Doenças de peixes tropicais comumente vistas são septicemia, doença do algodão, hidropisia, podridão das barbatanas, coceira, infecção da bexiga natatória, olho estourado, buraco na cabeça, etc.
Essas doenças podem ser tratadas com Sulfato de Kanamicina, Sulfato de Neomicina, Pimafix, Melafix, Contrast, Fungistop, Waterlife Cuprazin, Waterlife Myxazin, Waterlife Protozin, Waterlife Sterazin. As infecções parasitárias podem ser tratadas elevando a temperatura do tanque.