A microbiologia oral é o estudo dos microrganismos (microbiota) da cavidade oral e suas interações entre os microrganismos orais ou com o hospedeiro. O ambiente presente na boca humana é adequado para o crescimento de microorganismos característicos ali encontrados. Ele fornece uma fonte de água e nutrientes, bem como uma temperatura moderada. Os micróbios residentes da boca aderem aos dentes e gengivas para resistir à descarga mecânica da boca ao estômago, onde os micróbios sensíveis ao ácido são destruídos pelo ácido clorídrico.