A expressão gênica em células individuais varia de tecido ou amostra de cultura de acordo com o ciclo celular, diferenças genéticas, epigenéticas e estocásticas. A diferenciação unicelular é negligenciada na análise das consequências funcionais da variação genética. A expressão de 92 genes afetados pela sinalização em 1.440 células únicas de 15 indivíduos é medida individualmente para associar polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) com fenótipos de expressão gênica, enquanto contabiliza diferenças estocásticas e do ciclo celular entre as células. Tecidos complexos podem conter muito pequenas subpopulações de células com perfis únicos de expressão gênica e resultados médios de expressão gênica de muitas células podem mascarar mudanças sutis e importantes que ocorrem dentro de células individuais. Avanços técnicos no isolamento de células únicas,
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