Jornal de Farmacogenômica e Farmacoproteômica

Abstrato

Rumo a uma compreensão abrangente do miRNA Regulome e das redes de interação miRNA

Joseph J Nalluri, Debmalya Barh, Vasco Azevedo e Preetam Ghosh

Os miRNAs são reguladores vitais da expressão génica pós-transcricional. A desregulação dos miRNAs leva à suscetibilidade a muitas doenças, especialmente ao cancro. Os seus complicados mecanismos moleculares, compostos por fatores de transcrição a montante, alvos a jusante, processos funcionais e biológicos e regulamentações de doenças, ainda não estão totalmente esclarecidos. Portanto, compreender de forma abrangente a rede reguladora do miRNA é fundamental para modular as suas funções e desenvolver a terapêutica do miRNA. Atualmente, existem várias bases de dados e ferramentas independentes contendo informação específica sobre partes de um regulome de miRNA em silo, o que impede uma compreensão holística do mecanismo molecular do miRNA. Consequentemente, a integração de todos os conjuntos de dados dispersos de forma coesa, de modo a obter uma compreensão abrangente da influência contributiva e da efluência da maquinaria de um regulome de miRNA, é crítica. Neste artigo, apresentamos um relato de caso sobre o miRegulome, uma primeira base de conhecimento abrangente e integrada de regulome de miRNA e ferramentas analíticas de rede de interação de miRNA. O miRegulome integra os módulos moleculares essenciais de um regulome de miRNA numa plataforma coesa. Discutimos também as interações miRNA-doença do miRegulome e elaborámos estratégias teóricas gráficas para as analisar. Apresentamos também um design de nível seguinte para um repositório de base de dados melhorado para uma análise abrangente de dados, agrupando diversos conjuntos de dados relacionados com a biologia de miRNA; e apresentar a necessidade e os desafios para o desenvolvimento de novos algoritmos para prever novas interações entre miRNAs, genes, fatores de transcrição e doenças.