Jornal de Farmacogenômica e Farmacoproteômica

Abstrato

A prevalência de variantes raras potencialmente importantes para a resposta aos medicamentos utilizados no tratamento das DCV na população lituana

Pranculis A, RanÄ elis T, AmbrozaitytÄ— L, UktverytÄ— I, DomarkienÄ— I, BurokienÄ— N, KuÄ inskienÄ— ZA e KuÄ inskas V

As doenças cardiovasculares (DCV) são uma das principais causas de morte entre os europeus e em todo o mundo. Os principais fatores considerados relevantes para a eficácia ou reações adversas a medicamentos (RAMs) causadas por medicamentos utilizados no tratamento da DCV foram identificados através de estudos GWAS, principalmente utilizando matrizes de genotipagem de variantes comuns de baixa densidade. Neste estudo, foi realizada a sequenciação completa do exoma (WES) para identificar variantes genómicas relevantes para o tratamento da DCV. O grupo de estudo incluiu 98 (49 homens e 49 mulheres) indivíduos auto-reportados saudáveis ​​e não aparentados da população lituana com pelo menos três gerações de etnia lituana e residência na mesma região etnolinguística. Após a realização do WES, foram analisados ​​loci genéticos de 55 genes que foram reportados como relevantes para a eficácia ou RAM causadas por fármacos utilizados no tratamento da DCV utilizando os softwares LifeScopeTM e ANNOVAR. A análise de pequenos indels nas regiões selecionadas revelou 13 indels exónicos de frameshift e uma única variante de sítio de splicing intrónico que pode afetar a eficácia ou causar RAMs em doentes tratados para DCV. Mais de 400 SNVs potencialmente relevantes em diferentes frequências foram detetados nos genes reportados como importantes para o tratamento de DCV. A análise da força da evidência identificou 14 SNV com maior probabilidade de serem relevantes para o tratamento da DCV. A distribuição de frequência de vários alelos variantes que demonstraram ser altamente importantes para o tratamento de DCV no CYP2D6 (rs16947) e ADRB1 (rs1801253), bem como várias variantes nos genes CYP2C9 e NAT2 foram determinadas como sendo significativas (p<0,05) diferente de outras populações caucasianas, mostrando o potencial benefício dos testes farmacogenómicos antes do tratamento na população lituana. A investigação foi realizada no âmbito do projeto LITGEN. O projeto LITGEN (VP1-3.1-ŠMM-07-K-01-013) foi financiado pelo Fundo Social Europeu no âmbito da medida Global Grant.