Jornal de Farmacogenômica e Farmacoproteômica

Abstrato

Quantificação de visualizações de dados de mapa de calor para análise de alto rendimento

Paulo Juneau

Os mapas de calor têm sido utilizados como meio de visualizar informação de alta densidade em ambientes tão diversos como a astronomia, a análise de negócios e a meteorologia . As equipas de investigação em biologia de descoberta também utilizaram mapas de calor para visualizar agrupamentos de genes em investigações genómicas ou para estudar a distribuição de aminoácidos na análise de sequências proteicas. Os pacotes de software disponíveis comercialmente, como o Spotfire® ou o SAS JMP® proporcionam aos investigadores científicos a capacidade de construir mapas de calor e visualizar informações de estudos, mas não oferecem qualquer forma de estatística resumida que seria útil em investigações de alto rendimento comparando os resultados de um grande número de visualizações de dados em simultâneo ou visualização de alterações na visualização longitudinalmente (ao longo do tempo).

Anteriormente, Juneau sugeriu a utilização da caracterização de lacunaridade de Plotnick (1996) para exibições de dados de mapas de calor bidimensionais em duas cores ou tons. Para c (c>2) tons discretos (num mapa monocromático) ou matizes (numa visualização a cores), o autor irá sugerir uma modificação na abordagem de Plotnick utilizando a abordagem de caixa deslizante subjacente desenvolvida por Allain e Cloitre, mas com uma alteração nos meios de contagem de recursos.