Jornal de Farmacogenômica e Farmacoproteômica

Abstrato

Como a sequenciação de uma única molécula em tempo real pode melhorar o prognóstico e o aconselhamento genético na Distrofia Miotónica tipo 1

Stéphanie Tomé

A distrofia miotónica tipo 1 (DM1) resulta da expansão de uma repetição instável de CTG que geralmente aumenta ao longo das gerações e ao longo do tempo nos tecidos somáticos. A instabilidade da repetição do CTG e as manifestações clínicas da DM1 dependem da duração da repetição em si e da pureza da sequência repetida. O aconselhamento genético na DM1 é muito complexo, devido à apresentação clínica altamente variável e às dificuldades técnicas na determinação do tamanho e pureza da expansão do CTG. Utilizámos a sequenciação em tempo real de molécula única (SMRT) PacBio para medir com precisão o grande tamanho das repetições de CTG e identificar interrupções na sequência do alelo expandido para compreender a variabilidade clínica e genética em doentes com DM1. Sequenciámos vários doentes com DM1 com expansões de repetições de CTG que variam entre 130 a> 1000 repetições de CTG nos sistemas Sequel I e ​​II a partir de amplicons purificados. Obtivemos mais de 77% de leituras completas de DM1 por amostra, com> 70% das leituras de alelos expandidos. Os dados incluem leituras longas na gama de tamanhos esperada para todas as amostras, incluindo doentes com DM1 com mais de 1000 repetições de CTG (Tabela 1 e Ref1). O sequenciamento SMRT é muito promissor para sequenciar grandes expansões de repetições triplas, para identificar interrupções de repetições de CTG e para estimar o mosaicismo somático em doentes com DM1. Este método pode melhorar significativamente o prognóstico e o aconselhamento oferecido aos doentes.