Jornal de Farmacogenômica e Farmacoproteômica

Abstrato

Abordagem bioinformática para perfilar o microbioma oral e intestinal na colite

Sammed N Mandape

Os avanços na bioinformática e nas tecnologias de sequenciação de alto rendimento aumentaram significativamente a nossa capacidade de explorar o microbioma humano. O RNA ribossómico 16S (rRNA) é sequenciado para compreender a composição taxonómica do microbioma humano. Neste estudo, a análise bioinformática de dados sequenciados de 16S rRNA de doentes (colite de Crohn (CC) ou colite ulcerosa (UC)) e amostras de cólon saudável adjacentes foi realizada utilizando Quantitative Insights Into Microbial Ecology (QIIME). Além disso, considerando a informação específica da raça para estas amostras, foi realizada uma comparação das diferenças do microbioma do cólon entre afro-americanos e caucasianos. Como resultado, foram caracterizadas duzentas e oito espécies bacterianas diferentes. No entanto, apenas cinquenta e três bactérias foram descritas ao nível de espécie. A fracção de bactérias não prejudiciais nas amostras doentes de CC e UC foi diferente das amostras adjacentes de cólon saudável. Além disso, o microbioma das amostras doentes foi dominado por bactérias orais pertencentes aos Phyla Firmicutes (Streptococcus, Staphylococcus, Peptostreptococcus) e às Fusobacteria (Fusobacterium). Os resultados mostraram também diferenças no microbioma entre afro-americanos e caucasianos, indicando um potencial foco de investigação nas disparidades de saúde.