Jornal de Farmacogenômica e Farmacoproteômica

Abstrato

Para além dos SNPs e do CNV: Farmacogenómica de Repetições Polimórficas em Tandem

Evgeny Krynetskiy

As repetições polimórficas curtas em tandem (STR) surgiram como uma classe separada de mutação genética, que, juntamente com os polimorfismos de nucleótidos únicos (SNPs) e as variações do número de cópias (CNVs), podem explicar a variabilidade na resposta à farmacoterapia. O STR atrai interesse na investigação farmacogenómica devido à sua prevalência no genoma humano e ao seu suposto papel funcional como reguladores da expressão genética. Dependendo do algoritmo de pesquisa, existem aproximadamente 700.000–1.000.000 loci STR com motivos de 2 a 6 pb de comprimento no genoma de referência humano. O STR está distribuído de forma não aleatória entre regiões não traduzidas (UTRs), sequências codificadoras de proteínas e intrões, e está sobre-representado nas regiões promotoras dos genes humanos. O papel funcional do STR foi demonstrado pelos efeitos na expressão genética, splicing, sequência proteica e associação com efeitos patogénicos. Uma propriedade intrínseca do STR é a elevada taxa de mutação por expansão ou contracção no número de unidades repetidas. A variação do comprimento do STR desempenha um papel importante na modulação da expressão genética, sendo provável que o STR seja um elemento regulador geral que atenua a expressão de múltiplos genes. Elucidar os efeitos do STR na expressão genética pode explicar em parte a variabilidade na resposta ao fármaco, algo que não pode ser conseguido concentrando a análise exclusivamente nos SNPs ou nos CNV. Esta revisão resume o papel do STR polimórfico nas manifestações clínicas, incluindo a resposta à farmacoterapia.