Jornal de Farmacogenômica e Farmacoproteômica

Abstrato

Para além dos anos 50 da CI : Rumo a métodos estatísticos robustos para estudos de associação in vitro

Andrew Beam e Alison Motsinger-Reif

Os ensaios de citotoxicidade em linhagens celulares tornaram-se abordagens cada vez mais populares para estudos genéticos e genómicos de resposta citotóxica diferencial. Existe um número crescente de histórias de sucesso, mas relativamente pouca avaliação das abordagens estatísticas utilizadas em tais estudos. Na grande maioria destes estudos, a resposta à concentração é resumida utilizando abordagens de ajuste de curvas e, em seguida, as medidas resumidas são utilizadas como fenótipo em estudos subsequentes de associação genética. A curva é geralmente resumida por um único parâmetro, como o ponto de inflexão da curva (por exemplo, EC/IC50). Esta modelação faz suposições importantes e tem limitações estatísticas que devem ser consideradas. Na presente revisão, discutimos as limitações do EC/IC50 como fenótipo em estudos de associação e destacamos algumas potenciais limitações com uma experiência de simulação. Por fim, discutimos algumas abordagens alternativas de análise que se revelaram mais robustas.