Medicina tropical e cirurgia

Abstrato

Sequenciamento do genoma completo do Ômicron identificou múltiplos surtos e eventos de introdução na Índia durante novembro de 2021 e janeiro de 2022

Shreedhanya D. Marathe, Varun Shamanna, Geetha Nagaraj, Nischita S, Muthumeenakshi Bhaskaran, KL Ravi Kumar

A Variante Preocupante (VOC), Ômicron é a variante predominante circulando pelo mundo da pandemia de SARS CoV-2 durante a terceira onda, incluindo a Índia. A organização mundial da saúde designou essa variante altamente mutada como uma VOC devido à sua alta transmissibilidade e risco de reinfecção. O sequenciamento e a análise do genoma completo foram realizados para amostras positivas de PCR para SARS-CoV-2 entre dezembro de 2021 e janeiro de 2022. Das 133 variantes de Ômicron detectadas, a análise genômica foi realizada contextualizando-as com 1586 genomas completos de Ômicron da Índia obtidos do GISAID. A prevalência da variante Ômicron na Índia aumentou em uma fase logarítmica em 3 meses na maioria das cidades metropolitanas. Com os dados limitados de sequenciamento disponíveis, foi identificado que a sublinhagem BA.1 foi predominante na Índia de novembro de 2021 a janeiro de 2022. Além disso, a primeira sequência da sublinhagem BA.2 foi enviada de Delhi apenas em meados de dezembro de 2021. Os dois surtos observados foram da variante BA.2 e se espalharam para várias cidades em um curto espaço de tempo. A rápida disseminação e as mutações específicas nas amostras do surto de Ômicron indicam que a variante é altamente transmissível quando comparada às variantes anteriores. O estudo mostra a importância da sequência genômica para identificar o surgimento de clusters e tomar medidas para evitar novos eventos de disseminação.