Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics

Abstrato

A sequenciação completa do exoma revela uma combinação de variantes raras de alta e baixa penetração que se correlacionam com o risco relativo de cancro da mama familiar

Ben Rekaya Mariem, Hamdi Yosr, El Benna Houda, Mejri Nessrine, Jaidane Olfa, Ayari Jihene, Ben Nasr Sonia, Dallali Hamza, Messaoud Olfa, Meddeb Rym, Mighri Najah, Boujemaa Maroua, Boubaker Mohamed Samir, Haddaoui Abderazek, Mrad Ridha, Boussen Hamouda, Abdelhak Sonia, Labidi Soumaya1

Objectivo: O nosso objectivo foi investigar e identificar simultaneamente todas as variantes patogénicas raras e comuns em casos não relacionados de cancro da mama (CM).

Métodos: Todas as mutações frequentes nos genes BRCA previamente identificadas na Tunísia foram excluídas pela sequenciação Sanger em 42 mulheres afetadas com alto risco familiar, tendo pelo menos 3 indivíduos relacionados com cancro. Dois casos não relacionados com duas histórias familiares diferentes foram selecionados para sequenciação completa do exoma. As variantes selecionadas de alto risco foram confirmadas e foi realizada uma análise de segregação.

Resultados: Identificámos uma variante patogénica de perda de função por frame-shift em BRCA2 p.Val1283Lysfs em três casos e uma variante patogénica rara em OGG1, p.Arg46Gln que co-segrega com uma variante rara sem sentido em BRCA2, p.K3326X, em dois casos afetados por cancro da mama. Estas variantes nunca foram descritas na Tunísia ou no Norte de África.

Conclusão: A história familiar e a idade jovem de início do doente F1. 1 correlacionam-se com a presença de uma variante de alta penetração (p. Val1283Lysfs) no gene BRCA2. No entanto, a idade tardia de início e o fenótipo menos grave do doente F2.2 são consequência da presença de uma variante Lys3326X de baixa penetração no BRCA2 que co-segrega com uma variante patogénica p.Arg46Gln no gene OGG1 apenas nos casos de CB .