Jornal de Patologia Vegetal e Microbiologia

Abstrato

Usando o gene do fator de alongamento da tradução para detectar e diagnosticar especificamente Fusarium xylaroides , um agente causador da doença da murcha do café na Etiópia e na África Oriental e Central.

Olal S, Olango N, Kiggundu A, Ochwo S, Adriko J, Nanteza A, Matovu E, Lubega GW, Kagezi G, Hakiza GJ, Wagoire WW, Rutherford MA e Opiyo SO

O presente estudo apresenta o primeiro relatório sobre a aplicação da reação em cadeia da polimerase (PCR) baseada em DNA para a detecção e diagnóstico específicos de F usarium xylarioides (anamorfo: G ibberrela xylarioides). Fusarium xylarioides é o agente causador da doença da murcha do café (traqueomicose), e a doença é a restrição econômica mais importante na produção de café Robusta em Uganda. O patógeno tem duas raças, uma patogênica para o café Robusta e a outra para o café Arábica, e não vice-versa. Seu diagnóstico laboratorial tem sido baseado principalmente na microscopia, que é lenta, tem baixo poder discriminatório, requer alta experiência, aplicável apenas em plantas hospedeiras com sintomas e, desde então, não conseguiu detectar o patógeno do solo. O gene do fator de alongamento de tradução-1α (TEF-1α) de um F. xylarioides isolado de uma planta de café Robusta infectada foi amplificado pelo primer específico do gênero Fusarium e, em seguida, o produto de PCR foi sequenciado. Os dados da sequência foram então usados ​​para projetar o primer específico. O produto primer-BLAST foi encontrado para corresponder apenas às sequências de F. xylarioides compreendendo 75% da raça patogênica para Robusta e 25% para café Arábica. O teste in vitro por PCR mostrou que o primer era específico apenas para F. xylarioides amplificando um produto de 284 pb e foi capaz de diferenciar F. xylarioides de todas as espécies intimamente relacionadas de Fusarium e outros patógenos de plantas testados. Mais ainda, foi capaz de amplificar o DNA de todos os isolados de F. xylarioides de diferentes regiões de Uganda, e amplificou concentrações de DNA tão pequenas quanto 0,78 ng/µL.