Jornal de Doenças Infecciosas e Diagnósticos

Abstrato

O impacto dos ciclos de congelação e descongelação na integridade dos fluidos de cultura viral SARS-CoV-2 e das amostras clínicas remanescentes em testes de antigénio ou de ácido nucleico

Hajirah Noor Hussain, Hali Weeks, Derek Zhou, Divya Joseph, Brooke Lam, Haidong Xu, Chushi Zhang, Keqin Gregg, Wenli Zhou*

A preservação a temperaturas ultrabaixas tem sido um padrão de ouro para o armazenamento a longo prazo de muitos tipos de amostras clínicas, incluindo o vírus SARS-CoV-2. As amostras congeladas podem ser facilmente transportadas e testadas posteriormente. Além disso, as amostras congeladas remanescentes desidentificadas são recursos para muitos estudos pré-clínicos ou clínicos. Assim, é crucial compreender se os Ciclos de Congelação-Descongelação (FTCs) podem afetar adversamente o desempenho do teste SARS-CoV-2 quando são testadas amostras congeladas. Alguns estudos iniciais sugerem que os FTCs aumentaram o limiar do ciclo (Ct) da PCR em tempo real de transcrição reversa (RT-PCR ou RT-qPCR), indicando a potencial degradação do ácido nucleico do SARS-CoV-2 após os FTCs, enquanto os outros não o fizeram. Além disso, o impacto dos FTC no desempenho do teste do antigénio SARS-CoV-2 é pouco reportado.

Neste estudo, realizámos testes pareados de ácido nucleico e antigénio rápido nas mesmas amostras para investigar e comparar diretamente como os FTC afetam o desempenho de dois tipos de testes. Foram estudadas amostras de fluidos de cultura viral inativados e amostras de restos clínicos. Os nossos resultados mostraram que os FTCs tiveram efeitos negativos mínimos no desempenho do teste rápido de antigénio SARS-CoV-2, e os resultados dos testes permaneceram amplamente consistentes ao longo dos FTCs, enquanto os valores de Ct do RT-PCR aumentaram com o aumento dos números de FTC. Além disso, os nossos dados também demonstraram que o SARS-CoV-2 é melhor preservado no meio de transporte viral (VTM) do que na solução salina tamponada com fosfato (PBS) durante os FTC relativos aos testes de ácidos nucleicos.