Jornal de Patologia Vegetal e Microbiologia

Abstrato

A Exoribonuclease 2 5´ â†' 3´ como um alvo potencial para o desenvolvimento de fungicidas para controlar o mal-do-Panamá

Maldonado Bonilla LD e Calderón-Oropeza MA

Um surto de Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4 está atualmente ameaçando a produção global de bananas. Devido à natureza clonal das bananeiras comerciais, selecionar cultivares resistentes não parece viável; portanto, abordagens alternativas para proteção de culturas devem ser desenvolvidas. A exoribonuclease 5´ → 3´ XRN2/RAT1 está envolvida na degradação do RNA 5´ → 3´. Estudos fúngicos com XRN2 e mutantes condicionais ilustraram o papel crucial desta enzima, sugerindo que XRN2 deve ser considerado como alvo para a busca de novos inibidores que possam ser usados ​​como fungicidas para controlar o mal-do-Panamá. Nossa análise in silico da Tropical Race 4 XRN2 (FocTR4XRN2) revelou características da exoribonuclease 5´ → 3´, como o domínio catalítico que reconhece o RNA 5´-monofosforilado e catalisa a clivagem processada de mononucleotídeos. Uma cavidade delimitada mostrando o potencial para absorção de substrato parece propensa a interagir com pequenas moléculas que podem inibir sua atividade. O domínio catalítico em FocTR4XRN2 abriga um motivo CCHC, que é conservado em proteínas ortólogas de fungos filamentosos, mas ausente em leveduras. Os resíduos envolvidos na interação com a pirofosfohidrolase RAI1 também são conservados. O encaixe molecular revela a interação potencial de FocTR4XRN2 com o inibidor natural adenosina 3´, 5´ bisfosfato e sugere que essa abordagem é confiável para rastrear novos inibidores de enzimas que podem ajudar a suprimir a progressão de agentes causais da doença do Panamá.