Genética hereditária: pesquisas atuais

Abstrato

Estudos sobre a Caracterização Molecular do Gene DREB em Arroz Indica (Oryza sativa L.)

Jadhao KR, Samal KC, Pradhan SK e Rout GR

O número de potenciais genes candidatos (CGs) foi identificado por abordagens transcriptómicas e transgénicas envolvidas nas respostas adaptativas à seca em cereais. Um desses genes que confere tolerância à seca é a família de genes DREB. A exploração da variação genética/alélica dentro da família de genes DREB é um pré-requisito importante para uma melhor compreensão da tolerância ao stress. A presente investigação tem como objectivo estudar a variação alélica na sequência de nucleótidos do gene DREB de diferentes cultivares de arroz necessárias para programas de melhoramento de culturas. Foram utilizadas 10 cultivares de arroz de terras altas e de terras baixas para caracterização molecular e mineração de alelos. Os resultados mostraram que o gene DREB foi encontrado em todos os germoplasmas testados e submetidos ao NCBI GenBank (números de acesso KF 545561 a KF 545569). A análise bioinformática mostrou que 100 por cento de identidade com o domínio de ligação ao ADN AP2 de 59 aminoácidos que mostraram três folhas conservadas com 14ª valina e 19º resíduos conservados de ácido glutâmico. Verificou-se que o domínio AP2 da suposta proteína DREB é rico em aminoácidos alanina (17,6%) e arginina (15,7%) com uma massa molecular prevista de 5,89 kDa e ponto isoeléctrico (pI) 10,38. Observa-se que as sequências de nucleótidos do gene DREB foram verificadas com análise de polimorfismo de ADN, das quais foram identificados 196 sítios invariáveis ​​(monomórficos) e 8 variáveis ​​(polimórficos), isto é, segregantes, incluindo 9 números de mutações e 5 haplótipos. A diversidade de haplótipos (genes) foi de 0,756; a diversidade de variância e desvio padrão foi de 0,01678 e 0,130, respetivamente. O resultado mostrou que a variedade ‘Khandagiri’ apresentou 97,5% de similaridade com todos os acessos do gene DREB do arroz e 0,036% de divergência evolutiva com o acesso AK121956 presente na base de dados. Isto pode ter aumentado a capacidade do gene DREB como fator de transcrição e levado a proporcionar uma melhor adoção e capacidade de tolerância da cultivar durante a seca.