Jornal de Patologia Vegetal e Microbiologia

Abstrato

A impressão digital genômica Rep-PCR revelou diversidade genética e estrutura populacional entre isolados etíopes de Pseudocercospora griseola, patógeno do feijão comum ( Phaseolus vulgaris L.)

Yayis Rezene, Kassahun Tesfaye, Mukankusi Clare, Allan Male e Paul Gepts

A mancha angular da folha ( Pseudocercospora griseola ) é uma das doenças mais devastadoras que afetam a produção de feijão comum na maioria das partes da Etiópia. Assim, o uso de variedades de feijão comum com resistência durável é a medida de controle mais eficaz e econômica. O conhecimento sobre a variabilidade genética e a estrutura populacional das populações de patógenos é importante para um programa bem-sucedido de melhoramento do feijão comum. O objetivo deste estudo foi determinar a diversidade genômica existente entre e entre os isolados de P. griseola que foram obtidos da coleta de pesquisa de campo de diversas áreas de cultivo de feijão comum da Etiópia. O estudo usou o protocolo de reação em cadeia da polimerase de elementos palindrômicos extragênicos repetitivos para identificar a diversidade da sequência de DNA. Para estudar a diversidade genética, analisamos dados moleculares de 79 isolados de esporos únicos do patógeno P. griseola . Portanto, a Análise Molecular de Variância (AMOVA) e a análise de cluster revelaram a existência de alta diversidade genética dentro e entre os isolados de P. griseola . ERIC PCR produziu 21 padrões diferentes de clusters, enquanto REP-PCR e BOX PCR produziram 11 e 5 padrões diferentes de clusters, respectivamente. Isso ocorre porque alguns isolados que compartilhavam os mesmos padrões BOX puderam ser distinguidos pelos padrões de impressão digital ERIC e REP. Os padrões de impressão digital combinados ERIC, BOX e REP-PCR discriminaram 25 padrões diferentes entre os 79 isolados monospóricos de P. griseola produzidos na matriz de similaridade genética de 77% de corte. Esses clusters discriminados revelaram a existência de diversidade genética dentro e entre os isolados de P. griseola coletados nas diversas regiões de cultivo de feijão comum da Etiópia.