Jornal de Patologia Vegetal e Microbiologia

Abstrato

Relação entre Luteovirus e PAV-Barley Yellow Dwarf Virus

Hoda MA Waziri*, Hala A Amin, KE Saker, AM Soliman

O vírus anão amarelo da cevada (BYDV-PAV) isolado de plantas de trigo cultivadas no Egito foi caracterizado. Duas regiões codificadoras do vírus anão amarelo da cevada (BYDV-PAV) isolado para o gene da polimerase (P1) localizado no Open Reading Frame (ORF1) e o gene da proteína do revestimento (CP) localizado no Open Reading Frame (ORF3) foram alvos. Dois conjuntos de primers específicos foram projetados de acordo com o isolado BYDV-PAV no Genbank. Os fragmentos de DNA de ORF1 e ORF3 de um isolado egípcio de BYDV-PAV foram clonados e sequenciados. A sequência continha um ORF1 de comprimento total que codifica o gene da polimerase viral (P1). Ele compreende 910 nós de comprimento e codifica uma cadeia polipeptídica prevista de 303 aminoácidos com um M(r) de 34,67. Por outro lado, os dados de sequência para o ORF3 que codifica a proteína do revestimento viral revelaram que ele tinha 603 pb de comprimento e codificava uma proteína prevista de 200 aminoácidos, com peso molecular de 21,96 KDa. No entanto, a árvore de homologia filogenética baseada nos alinhamentos de sequências múltiplas do isolado egípcio Egy-Wz com aqueles isolados disponíveis no NCBI GenBank revelou que o gene da polimerase (P1) compartilhou 76,5%-99% e 71,6%-93,2% de identidades de sequência em níveis de aminoácidos e nucleotídeos com os isolados 05GG2, PAV 014 e PAV014, PAV-Aus, respectivamente. Por outro lado, o gene da proteína do revestimento (CP) mostrou 85,1%-99,5% e 89,7%-99,2% de similaridade de sequência com dois isolados 06KM14 e 05GG2 no nível de aminoácidos e nucleotídeos, respectivamente.