Jornal de tecnologia microbiana e bioquímica

Abstrato

Tecnologia Recente de Microbiologia Clínica; Sequenciação do genoma completo (WGS) e espectrometria de massa por tempo de voo por dessorção a laser assistida por matriz (MALDI-TOF MS)

Jeongsook Y

A questão mais quente no campo da microbiologia clínica nos últimos anos é a aplicação da sequenciação do genoma completo (WGS) ao diagnóstico clínico e à terapêutica através da metodologia de sequenciação de nova geração. A aplicação do WGS inclui a identificação de espécies, o estudo epidemiológico e o estudo da resistência antimicrobiana e assim por diante. A análise baseada no polimorfismo de nucleótidos únicos (SNP) aumenta a precisão e a sensibilidade da identificação de espécies através de um poder discriminatório acentuado, e a capacidade de rastreio do processo de transmissão permite o controlo de infeções, incluindo surtos. Podemos esclarecer o mecanismo de resistência antimicrobiana das betalactamases ou carbapenemases de espectro alargado e elucidar o mecanismo de transferência horizontal das ilhas genómicas móveis. No caso de criação de um novo método de PCR, o alvo e o primer poderão ser escolhidos utilizando bases de dados WGS. O método MALDI-TOF é utilizado em quase todos os laboratórios, identificando espécies bacterianas, fúngicas e micobacterianas. A identificação direta no frasco de hemocultura é possível em doentes com bacteremia, podendo ser detetadas Beta-lactamases ou Carbapenemases. Além disso, pode ser aplicado na toxina Shiga E. coli, nos serotipos de Salmonella ou nos ribotipos de C. difficile.