Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics

Abstrato

Previsão da estrutura 3D da toxina inseticida paralítica (ITX-1) de Tegenaria agrestis (Hobo Spider)

AGIngale e NJChikhale

A toxina inseticida paralítica (ITX-1) (Tegenaria agrestis) envolveu múltiplos componentes antigénicos para direcionar e capacitar o sistema imunitário para proteger o hospedeiro contra infeções. As toxinas peptídicas de aranha com afinidades nanomolares para os seus recetores são ferramentas farmacológicas promissoras para a compreensão do papel fisiológico dos canais iónicos e como pistas para o desenvolvimento de novos agentes terapêuticos e estratégias para doenças relacionadas com os canais iónicos. Foi desenvolvido um modelo tridimensional (3D) para a toxina inseticida paralítica do (ITX-1) de Tegenaria agrestis (aranha Hobo). Foi utilizado um método de modelação por homologia para a previsão da estrutura. Para a modelação, foi obtida uma proteína modelo pelo mGenTHERADER, nomeadamente a estrutura de cristalografia de raios X de alta resolução de uma FERREDOXINA (1FCA) de Clostridium acidurici. Ao comparar a proteína modelo, foi construído um modelo aproximado para a proteína alvo utilizando o MODELLER, um programa para modelação comparativa. O modelo foi validado utilizando ferramentas de verificação de estrutura proteica como o PROCHECK e o WHAT IF para fiabilidade. A informação assim abordada fornece informação para a compreensão molecular da toxina inseticida paralítica (Tegenaria agrestis). O modelo 3-D previsto pode ser posteriormente utilizado na caracterização da proteína em laboratório húmido.