Ch KK, Jamil K, Raju GS
A farmacogenómica utiliza ferramentas de bioinformática para estudar como a composição genética de um indivíduo afeta a resposta do organismo aos medicamentos. O nosso objetivo foi compreender o possível papel das variações estruturais no gene metabolizador de fármacos contra o cancro da mama, como o MTHFR, que interage estreitamente com os fármacos neoplásicos, viz. Ciclofosfamida, 5-Fluorouracilo, Metotrexato e outros. Investigámos o polimorfismo no gene que pode afetar a capacidade de ligação destas moléculas ao fármaco. Utilizámos o navegador do genoma VEGA para obter informações sobre a estrutura do gene e dbSNPs do NCBI para SNPs. A sequência proteica foi recuperada da base de dados NCBI e utilizando o método Swiss Homology foi construída a estrutura proteica. O software TRITON baseado em Linux foi utilizado para estudar e determinar as mutações na estrutura. Para prever as variações nas capacidades de ligação aos fármacos dos agentes quimioterapêuticos, utilizámos o Molegro Virtual Docker. Este estudo revelou que a energia de ligação para as estruturas MTHFR mutadas das proteínas era superior à das proteínas do tipo selvagem. Isto indica que mutações que causam modificações estruturais modularam as energias de ligação do fármaco com vários ligantes (fármacos). Mostra, portanto, que as variações na estrutura das proteínas influenciam a capacidade de ligação ao fármaco e também influenciam a toxicidade do fármaco relacionada com as interações fármaco-gene. Este é o primeiro relatório computacional para estas interações entre medicamentos e genes. Este estudo determinou as interações farmacogenómicas em medicamentos quimioterápicos comummente utilizados para o cancro da mama. Este poderá ser um estudo modelo para o desenho de fármacos ou seleção de um fármaco adequado à resposta genómica de cada doente.