Sareaa MG Al-Mayahie, Alaa AM Al-Khafajy, Nuha AS Dosh, Assel RK Al-Rekabi e Ahlam GN Al-Atabie
Os isolados fecais de Escherichia coli estão divididos em quatro grupos filogenéticos principais designados A, B1, B2 e D. A maioria das estirpes comensais pertence ao grupo A e tem menos fatores de virulência do que as estirpes de E. coli patogénicas extraintestinais (ExPEC) . Este estudo foi desenhado principalmente para o agrupamento filogenético de isolados fecais comensais de E. coli de homens e mulheres saudáveis na cidade de Al-Kut/província de Wasit/Iraque utilizando protocolos baseados em PCR. Foram também detectados genes de virulência do ExPEC entre estes isolados. Entre os isolados incluídos neste estudo (n=205), o grupo A foi o mais comum entre os isolados femininos e masculinos (68,5% vs. 63,0%, respetivamente), seguido dos grupos: B1 (15,7% vs. 22,6%, respetivamente). ), D (10,7% vs. 9,5%, respetivamente) e B2 (4,1% vs. 4,7%, respetivamente). A distribuição por género dos grupos filogenéticos mostrou diferenças insignificantes entre mulheres e homens. Os isolados de fêmeas e machos não diferiram significativamente para todos os genes de virulência do ExPEC detetados, exceto para o papC que foi significativamente (P ≤ 0,05) mais prevalente entre os isolados de machos (16,6%) do que entre os isolados de fêmeas (6,6%). Nos isolados de fêmeas e machos, os genes de virulência mais prevalentes foram o fimH (97,5% vs. 100%, respetivamente) e o iucC (52,0% vs. 55,9%, respetivamente), enquanto os menos prevalentes foram o sfa /foc (0% cada ) e hly (0,82% vs. 0%, respectivamente). Além disso, os genes de virulência estavam concentrados em isolados agrupados no grupo B2.
Tanto em mulheres como em homens, uma elevada percentagem de isolados de E. coli fecais comensais dominantes de pessoas iraquianas na cidade de Al-Kut agruparam-se no filogrupo A seguido pelos grupos B1 e D, enquanto o grupo B2 era raro. Além disso, as estirpes fecais dominantes com características ExPEC foram muito menos prevalentes.