Jornal de Bioequivalência e Biodisponibilidade

Abstrato

Otimização de chumbo baseada em farmacocóforo e análise de encaixe molecular para a detecção de inibidor potente contra a proteína HCRTR2

Maryam Maqbool*

A insônia é um problema crescente de saúde pública, pois sua prevalência está aumentando dia a dia. É um dos distúrbios do sono mais comuns entre os asiáticos. Cada 1 em cada 10 pessoas que sofrem de insônia tem insônia. Entre todos os distúrbios do sono, cerca de 6-10% atendem aos critérios para insônia. É altamente frequente em mulheres em comparação aos homens. Neste trabalho de pesquisa, focamos na identificação de potenciais medicamentos baseados em alvos para fornecer tratamento eficaz a partir de plantas medicinais. Neste estudo de pesquisa, a abordagem de farmacóforo baseada em ligante foi usada, seguida de encaixe molecular e triagem virtual. O servidor Protox foi usado para a previsão da classe de toxicidade. Propriedades moleculares de constituintes químicos que possuem propriedades anti-insônia verificadas via Swiss ADME, ferramenta de previsão de propriedade ADMET e ferramenta exploradora de propriedade Osiris. O farmacóforo baseado em ligante de quatro compostos de Osmium basilicum foi realizado e então rastreado em relação às bibliotecas de bancos de zinco, Princeton e Drug Bank usando o ligand scout e então composto com maior pontuação de ajuste de farmacóforo com CID NS_013367, NS_005529, NS_007342, NS_011378 e NS_011361. NS_011285 foram selecionados para encaixe. O encaixe molecular foi realizado da proteína alvo HCRTR2 desejada com os compostos selecionados um por um usando Autodockvena e então a melhor pose que mostra o melhor ângulo de orientação de localização foi selecionada para estudo posterior que exibe energia de ligação mínima e os resultados de encaixe foram analisados ​​por Pymol e discovery studio. O composto com número CID NS_011285 possui melhor pose e mais menos energia de ligação -9,4 em comparação com outros compostos. A estrutura 2D mostra a interação do aminoácido MET, VAL, LEU, PHE e ARG 2D com a proteína mutada HCRTR2 e o tipo de interações como Alquil, Pi-Alquil, Pi-Sigma e Pi-Enxofre. Finalmente, identificamos o ligante que possui as melhores propriedades de semelhança com drogas e potencial para inibir a atividade do HCRTR2, que é o principal culpado do distúrbio de insônia.