Jornal de Patologia Vegetal e Microbiologia

Abstrato

Caracterização patogênica e genética de raças de Xanthomonas campestris Pv. campestris com base em Rep-PCR e análise de sequência multilocus

Priyanka Singh Rathaur, Dinesh Singh, Richa Raghuwanshi e Yadava DK

Xanthomonas campestris pv. campestris (Pammel) Dowson (Xcc) é o agente causal da doença da podridão negra de crucíferas em todo o mundo. Setenta e cinco isolados de Xcc foram coletados de 12 regiões agroclimáticas da Índia para determinar o padrão de distribuição de raças e a diversidade da população. Com base na reação patogênica em sete crucíferas diferenciais padrão, as raças 1, 4 e 6 foram consideradas prevalentes. Para avaliar a diversidade patogênica, quarenta e uma cultivares de crucíferas compreendendo sete espécies de Brassica e coeno foram inoculadas artificialmente em condições de campo. As cultivares de Brassica juncea (Pusa Bold, Varuna, Pusa Vijay, Pusa Mustard 21 e Pusa Mustard 25) mostraram resistência contra todas as cepas de Xcc, enquanto a cultivar de Brassica olerecea Pusa Ageti foi considerada resistente às raças 1 e 4. A caracterização genética dessas 75 cepas de Xcc foi realizada usando rep-PCR (ERIC, REP e BOXPCRs) seguida de análise filogenética . As cepas de Xcc se agruparam em 6 grupos com coeficiente de similaridade de 50% e, entre esses grupos, 28 cepas de Xcc pertencentes às raças 1, 4 e 6 foram agrupadas no Grupo 5. Sequências dos genes 16S rRNA, hrpF e efP de cinco cepas representando as raças 1, 4 e 6 foram usadas para análise de sequência multilocus. Com base na análise de sequência dos genes 16S rRNA e hrpF, descobriu-se que as cepas indianas estavam intimamente relacionadas à cepa Xcc ATCC 33913 (raça 3, Reino Unido), enquanto com base nas sequências efP, descobriu-se que elas estavam intimamente relacionadas às cepas raça 1 Xcc B100 (Itália) e raça 9 Xcc 8004 (Reino Unido).