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Abstrato
Abordagem proteómica microbiana para previsões quantitativas sensíveis do peptídeo de ligação ao MHC de Taenia Ovis
Gomase VS e Chitlange NR
A Taenia ovis é um parasita ténia com o estado adulto do parasita encontrado no intestino dos cães, enquanto o estado intermédio ou larvar é encontrado nos músculos das ovelhas, causando o sarampo ovino. Os fragmentos peptídicos da proteína antigénio podem ser utilizados para selecionar não-nomes para utilização no design racional de vacinas e para aumentar a compreensão dos papéis do sistema imunitário em doenças infeciosas. A análise mostra que os péptidos de ligação à proteína antigénica de classe II do MHC de Taenia ovis são determinantes importantes para a protecção do hospedeiro contra a infecção parasitária. Neste ensaio, utilizámos os algoritmos PSSM e SVM para o desenho do antigénio e previmos a afinidade de ligação da proteína antigénica com 254 aminoácidos, que mostra 246 não-nomes. A previsão da capacidade de ligação dos péptidos antigénicos às moléculas do Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) de classe I e II é importante no desenvolvimento de vacinas contra o sarampo ovino.