Jornal de pesquisa e terapia com células-tronco

Abstrato

Células estromais mesenquimais e morfogénese vascular: perfis de expressão génica e vias de promoção

Rogier TA Van Wijck

RESUMO
Objectivo: As células hematopoiéticas e as células estromais mesenquimais estão intimamente relacionadas com as células endoteliais nas
linhagens de diferenciação celular embriológica. Para estudar a patobiologia da imunologia vascular e o microambiente
na morfogénese vascular, analisámos os fatores genéticos conhecidos por estarem envolvidos nas anomalias vasculares em humanos
e ratinhos nos dados de expressão do Projeto Genoma Imunológico (ImmGen).
Métodos: Extraímos as imagens de síndromes padrão de malformações não diagnosticadas e
as bases de dados NCBI Online Mendelian Inheritance in Man para construir uma lista de genes relacionados com a vasculatura. Estudámos as
assinaturas de expressão destes genes na base de dados ImmGen. As análises de agrupamento hierárquico foram realizadas utilizando o Partek®
Genomics Suite 6.6. De seguida, os clusters adquiridos foram investigados separadamente na Ingenuity Pathway Analysis
(IPA). Com base nestes resultados, realizámos uma Análise de Componentes Principais (PCA) com amostras de pericitos de uma
base de dados separada para investigar a relação com os pericitos.
Resultados: As nossas consultas à base de dados resultaram numa lista de genes de 438 genes relacionados com a vasculatura, dos quais 384 puderam ser
estudados no conjunto de dados ImmGen. Através do agrupamento hierárquico identificámos cinco agrupamentos distintos, dos quais
um era específico para expressão em linhagens celulares mesenquimais. De seguida, usando o IPA, encontrámos vários caminhos relacionados com as
funções dos pericitos. Um PCA subsequente com amostras de pericitos mostrou uma grande semelhança com células estromais específicas de
origem mesenquimal, indicando perfis de expressão partilhados para genes vasculares entre pericitos e estes tipos de células.
Estes resultados indicam que os processos de Transição Epitelial-Mesenquimal e ou
Transição Endotelial-Mesenquimal estão subjacentes à interação entre as células epiteliais / endoteliais e as células estromais mesenquimais na
morfogénese vascular.
Conclusão: Neste estudo de análise de dados, realizamos a fusão de dados de várias fontes que podem auxiliar futuros
estudos mecanísticos e terapêuticos no desenho do estudo e na seleção do tipo celular, bem como fornecer uma estratégia potencial
para encontrar alvos terapêuticos com base nos mecanismos moleculares patológicos específicos relacionados com anomalias vasculares.