Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics

Abstrato

Genes e proteínas da glutamil aminopeptidase de mamíferos (ENPEP): estudos comparativos de um importante contribuidor para a hipertensão arterial

Roger S Holmes, Kimberley D Spradling-Reeves e Laura A Cox

A glutamil aminopeptidase (ENPEP) é um membro da família M1 de endopeptidases que são endopeptidases de membrana integral tipo II de mamíferos contendo zinco. A ENPEP está envolvida na via catabólica do sistema reninangiotensina formando a angiotensina III, que participa na regulação da pressão arterial e na formação de vasos sanguíneos. As sequências e estruturas comparativas de aminoácidos ENPEP e localizações de genes ENPEP foram examinadas utilizando dados de vários projetos de genomas de mamíferos. As sequências ENPEP de mamíferos partilharam 71-98% de identidades. Foram conservados cinco locais de N-glicosilação para todas as proteínas ENPEP de mamíferos examinadas, embora tenham sido observados 9-18 locais, em cada caso. Foram também estudados alinhamentos de sequências, resíduos de aminoácidos chave e estruturas secundárias e terciárias previstas, incluindo sequências transmembranares e citoplasmáticas e resíduos de sítios ativos. Os níveis mais elevados de expressão de ENPEP humana foram observados no íleo terminal do intestino delgado e no córtex renal. Os genes ENPEP de mamíferos continham 20 exons codificantes. O promotor do gene ENPEP humano e o primeiro exão codificante continham uma ilha CpG (CpG27) e pelo menos 6 locais de ligação ao fator de transcrição, enquanto a região 3’-UTR continha 7 locais alvo de miRNA, o que pode contribuir para a regulação da expressão do gene ENPEP nos tecidos do organismo. As análises filogenéticas examinaram as relações entre os genes e as proteínas ENPEP de mamíferos, incluindo primatas, outras fontes eutéricas, marsupiais e monotremadas, utilizando a ENPEP de galinha como sequência primordial para fins comparativos.