Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics

Abstrato

Interação de proteínas e vias no tecido cerebral da doença de Alzheimer humana usando espectrometria de massa

Malathi Narayan, Lisa Kirouac, Dale Chaput, Stanley Stevens, Jaya Padmanabhan e Umesh K Jinwal

A doença de Alzheimer (DA) é a forma mais comum de demência e a sexta principal causa de morte nos Estados Unidos. As principais características patológicas observadas na DA incluem a formação de emaranhados neurofibrilares intracelulares compostos por formas fosforiladas da proteína tau associada aos microtúbulos e a deposição de placas extracelulares compostas por beta amilóide. O Cdc37 é um co-acompanhante do Hsp90, que recruta quinases clientes para o complexo Hsp90 para enovelamento e estabilização. Foi demonstrado anteriormente que o Cdc37 pode não só ligar e preservar a tau, mas também estabilizar quinases que podem fosforilar a tau. O objetivo do presente estudo foi identificar novas proteínas que interagem com Cdc37 em tecido humano com DA em comparação com tecido normal, utilizando uma abordagem baseada na imunoprecipitação combinada com espectrometria de massa. Identificámos 39 proteínas únicas que interagiram com Cdc37 apenas em amostras de DA e 7 proteínas que interagiram com Cdc37 apenas em amostras normais. Verificou-se que 39 proteínas se ligam ao Cdc37 tanto na DA como no tecido normal. Destes, 18 apresentaram uma interação aumentada no tecido da DA, 10 apresentaram uma interação aumentada no tecido normal e 11 apresentaram uma interação igual em ambas as amostras. A análise da via de engenhosidade dos dados indica que estas proteínas que interagem com Cdc37 poderão sinalizar através das vias p70S6K, PI3K/Akt, TGFß, ErbB, NF-kB, calmodulina, p38 MAPK e JNK. A identificação destas novas proteínas e vias ligadas ao Cdc37 pode indicar o seu papel tanto como co-acompanhante não-quinase como noutras vias no cérebro da DA.