Biologia e Medicina

Abstrato

Abordagens integrativas de bioinformática para analisar eventos moleculares em pluripotência

Priyanka Narad e Upadhyaya KC

As células estaminais embrionárias humanas (hESCs) têm a capacidade de proliferar quase indefinidamente. A análise dos perfis de expressão genética das hESCs poderá oferecer uma visão sobre os genes cruciais envolvidos na manutenção da pluripotência e os genes que podem estar envolvidos na diferenciação celular. A combinação de dados de rede e de alto rendimento permite compreender o papel dos mecanismos epigenéticos, vias de sinalização e fatores de transcrição responsáveis ​​​​​​na pluripotência humana e triagem de supostas relações mecanicistas, validação do conhecimento existente, produção de hipóteses e sugestões para novas experiências. A descodificação do centro de fatores e as suas interações associadas é um começo importante para compreender as complexidades associadas aos hESCs e transferir o conhecimento para a criação de células estaminais pluripotentes induzidas por humanos (hIPS). Esta revisão tem como objetivo aumentar a informação elementar das abordagens de bioinformática integrativa úteis para estudar processos de autorrenovação e diferenciação utilizando novos dados holísticos sobre a expressão genética e marcas epigenéticas associadas à pluripotência celular. Duas abordagens básicas, nomeadamente a representação como redes biológicas e a tecnologia da web semântica, foram descritas para o gerenciamento dos dados de alto rendimento cada vez maiores. Uma abordagem integrada para desvendar as complexidades biológicas seria altamente benéfica no campo das ciências médicas e da saúde.