Bioquímica e Bioquímica Analítica

Abstrato

Identificação de possíveis alvos de fármacos e candidatos a vacinas para agentes patogénicos que causam aterosclerose

Kanipakam Hema, Vani Priyadarshini I, Dibyabhaba Pradhan, Manne Munikumar, Swargam Sandeep, Swargam Sandeep, Natarajan Pradeep, Suchitra MM e Amineni Umamaheswari

A aterosclerose é uma doença arterial inflamatória crónica, responsável por acidente vascular cerebral (coração) e cerebrovascular (cérebro), com elevada morbilidade e mortalidade em todo o mundo. Patógenos infecciosos como Chlamydophila pneumoniae, Porphyromonas gingivalis e Helicobacter pylori demonstraram estar associados à doença em estudos epidemiológicos recentes. Assim sendo, a identificação de alvos comuns de fármacos e vacinas candidatas contra estes três agentes patogénicos seria vital para a terapêutica e gestão da aterosclerose. A pneumonia por Chlamydophila foi selecionada como organismo de referência devido ao seu papel predominante na aterosclerose. Implementando uma abordagem genómica comparativa, uma abordagem genómica subtrativa, análise de vias metabólicas, análise de flora intestinal não homóloga e análise de pesquisa de domínios, foram identificados 35 possíveis alvos comuns de medicamentos contra os agentes patogénicos da aterosclerose. Estudos de localização subcelular foram realizados e identificaram a proteína UvrABC como vacina candidata. A análise das vias metabólicas mostrou que, dos 35 alvos de medicamentos, 14 enzimas participavam em vias-chave ligadas à sobrevivência, proliferação e patogénese do agente patogénico , sem qualquer mecanismo alternativo para sintetizar o produto. A análise da microbiota intestinal foi realizada para identificar os alvos dos fármacos que não afetam a microbiota dos humanos. A pesquisa de domínios foi realizada para os 14 alvos de fármacos identificados utilizando as bases de dados Pfam e SMART e a análise da rede proteica foi realizada utilizando o STRING e o Cytoscape v3.2.0. Os alvos medicamentosos e as vacinas candidatas propostas no presente estudo serviriam de base para conceber inibidores potentes e vacinas de subunidades através da abordagem in silico para combater a aterosclerose causada por agentes patogénicos infecciosos.