Abstrato

Identificação e caracterização de origens de replicação de múltiplos cromossomos em Rhodobacter sphaeroides

Berra Koskulu, Abha Choudhary, Hannah Johnson, Hyuk Cho e Madhusudan Choudhary

A replicação do DNA tem sido extensivamente estudada em várias espécies bacterianas, que possuem um genoma unipartido consistindo de um único cromossomo circular. Aproximadamente 10% das espécies bacterianas sequenciadas têm uma estrutura de genoma multipartida, que é composta de múltiplos cromossomos. No entanto, a coordenação e regulação da replicação multicromossômica em bactérias permanece pouco compreendida. Rhodobacter sphaeroides possui um genoma multipartido consistindo de dois cromossomos, o cromossomo primário (CI) de aproximadamente 3 Mb e o cromossomo secundário (CII) de 0,9 Mb. As análises de curva Z e GC skew revelaram que CI e CII de R. sphaeroides exibem três e cinco regiões de origem cromossômica putativas, respectivamente. Então, as regiões de flanqueamento dessas regiões putativas foram analisadas em termos de conservação de genes, densidade genética e proporções de genes entre as fitas direta e complementar correspondentes, previamente identificadas perto das origens replicativas biologicamente confirmadas de espécies bacterianas que estavam intimamente relacionadas a R. sphaeroides. Subsequentemente, todas as regiões replicadoras putativas foram clonadas em um plasmídeo pLO1, um vetor suicida em R. sphaeroides. A replicação autônoma desses plasmídeos recombinantes em R. sphaeroides foi examinada mais detalhadamente usando métodos de conjugação e moleculares. Os resultados demonstraram que CI e CII de R. sphaeroides têm uma única origem de replicação em seus cromossomos, respectivamente, e isso fornecerá a base para trabalhos futuros sobre coordenação e controle de replicação e segregação de múltiplos cromossomos em bactérias.

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