Jornal de tecnologia microbiana e bioquímica

Abstrato

Identificação e caracterização dos genes gtf, norB e trx em Flavobacterium Columnare

Yinfeng Zhang e Covadonga R. Arias

Três genes de uma biblioteca genómica shotgun da estirpe virulenta ALG-00-530 de Flavobacterium columnare foram identificados, caracterizados e selecionados para análise de expressão diferencial com base na semelhança de sequência com supostos genes de virulência de espécies relacionadas. Estes genes foram: glicosiltransferase (gtf), óxido nítrico redutase (norB) e tioredoxina (trx). Uma coleção de 30 estirpes de F. columnare, incluindo estirpes dos genomovares I e II, foram testadas quanto à presença destes genes. Os padrões de distribuição de gtf, norB e trx entre as espécies não foram uniformes. Foi observada variação na sequência de nucleótidos entre genomovares para cada gene; no entanto, estirpes dentro do mesmo genomovar partilhavam sequências genéticas idênticas. Nove estirpes de F. columnare, de ambos os genomovares, foram escolhidas para análise da expressão génica. O perfil de expressão destes genes variou quando estirpes seleccionadas foram cultivadas in vitro em condições idênticas. A ALG-00-530, uma estirpe altamente virulenta, foi escolhida para comparação da expressão genética em condições padrão de crescimento, condições limitadas em ferro e na presença de explantes de pele de peixe-gato do canal. Os níveis de expressão dos genes NorB e trx variaram quando o ALG-00-530 foi incubado em diferentes condições.