Jornal de pesquisa e terapia com células-tronco

Abstrato

Sequenciação maciça de todo o genoma na biologia das células estaminais embrionárias: perceções e desafios recentes

Yaofeng Wang, Alex Chun Cheung, Jun-Tao Guo e Bo Feng

A descoberta de células estaminais embrionárias pluripotentes (ESCs) em mamíferos transformou enormemente a investigação com células estaminais e a medicina regenerativa. Para compreender o mecanismo molecular da pluripotência, as tecnologias de sequenciação massiva têm sido adotadas com intenso interesse científico devido às suas vantagens, incluindo a alta resolução, o baixo ruído, bem como a sua extensa cobertura em todo o genoma. Aqui revemos os princípios das tecnologias de sequenciação massiva de todo o genoma amplamente realizadas em estudos de CES, incluindo ChIP-Seq, RNA-Seq e metilCSeq. Melhorias e aplicações recentes destas tecnologias serão também discutidas. Além disso, será apresentado um resumo de várias metodologias utilizadas para integrar os dados de sequenciação massiva do genoma. A integração de dados massivos que delineiam diferentes aspetos das CES pode levar a inúmeras inovações para a compreensão das redes de transcrição na manutenção da pluripotência, bem como regulações genéticas e modificações epigenéticas nas CES, que são importantes para a investigação e aplicações clínicas. Além disso, destacamos as características que merecem atenção por parte dos biólogos devido aos desafios atuais na análise massiva de dados de sequenciação em bioinformática e bioestatística.