Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics

Abstrato

Genome mining e análise transcricional de genes de bacteriocinas em Enterococcus faecium CRL1879

Suárez N, Bonacina J, Hebert EM e Saavedra L*

Entre 151 isolados bacterianos de nove queijos artesanais, o Enterococcus faecium CRL 1879 apresentou atividade antibacteriana contra o patogéneo de origem alimentar Listeria monocytogenes. O isolado produziu um composto sensível à proteinase K no sobrenadante livre de células. A análise do genoma demonstrou a presença de agrupamentos de genes biossintéticos de enterocina A, enterocina B, enterocina P, tipo enterocina SE-K4 e enterocina X. As sequências de nucleótidos que codificam uma suposta bacteriocina de dois componentes foram detetadas utilizando ferramentas de bioinformática, aqui designadas por enterocina CRL1879αβ. Uma análise transcricional de todos os genes da bacteriocina por análise quantitativa de PCR em tempo real (qRT-PCR) revelou a transcrição de cada gene da enterocina a diferentes níveis. Por fim, a análise da distribuição dos genes da bacteriocina em 251 bioprojectos de E. faecium foi realizada e comparada com os identificados em E. faecium CRL1879. A análise discriminativa demonstrou que os genes da bacteriocina estão amplamente distribuídos entre os Enterococcus, independentemente da origem da estirpe.

Os resultados apresentados neste artigo representam um achado único, uma vez que esta é a primeira demonstração de uma estirpe de E. faecium isolada de um queijo artesanal com maquinaria genética completa para produzir seis bacteriocinas de classe II e uma de classe III.