Jornal de tecnologia microbiana e bioquímica

Abstrato

Exploração da eletroforese em gel gradiente desnaturante na análise da diversidade microbiana

Xá MP

Uma aplicação de eletroforese em gel gradiente dos fragmentos do gene amplificado por PCR foi a hidrogenase. A análise comparativa das sequências do gene da hidrogenase [NiFe] foi concebida com cinco iniciadores de PCR diferentes. Estes iniciadores foram testados em várias combinações em ADN genómico de diferentes bactérias contendo hidrogenase e sem hidrogenase. Para as espécies desulfovibrio pareceu existir apenas um par de iniciadores específico, enquanto outras deram resultados positivos com outras bactérias. Utilizando este par específico de primers, conseguimos amplificar os genes da hidrogenase [NiFe]. No entanto, só depois foi possível definir a análise DGGE destes produtos de PCR pelo número de diferentes espécies de desulfovibrio nas amostras. A análise DGGE de produtos de PCR de diferentes biorreatores demonstrou até dois radicais, em que foram detetadas pelo menos cinco bandas distinguíveis na amostra de tapete microbiano. Uma vez que estes grupos são provavelmente o mesmo número de espécies de desulfovibrio nestas amostras, concluímos que a diversidade genética na espécie de tapete microbiano natural de desulfovibrio é muito maior do que nos biorreatores experimentais.