agrotecnologia

Abstrato

Avaliação da diversidade genética em inhame aéreo ( Dioscorea bulbifera L) utilizando marcadores de repetições de sequência simples (SSR)

Aniefiok Ndubuisi Osuagwu, Edem UL

Dioscorea bulbifera é uma cultura subutilizada da família Dioscoreacea amplamente distribuída pelas regiões tropicais e subsaarianas da África Ocidental. Vinte e cinco acessos de D. bulbifera da África Ocidental mantidos no banco de germoplasma do Instituto Internacional de Agricultura Tropical (IITA) foram selecionados quanto à diversidade genética utilizando dez locos microssatélites em reação de volume de 25 ul em reações de PCR de microplaca de 96 poços. A mistura de reacção foi constituída por 3 µl de ADN modelo 10 ng/ µl , 2 µl de DNTPs 2,5 mM, 1 µl de MgCl ₂ 2,5 mM , 1 µl de cada um dos iniciadores forward e reverso, 1 µl de DMSO ₄ , 0,1 µl de Taq DNA polimerase 5 µg/ µl (Invitrogen) e 3 µl de 10 ng / µl de DNA. O volume total da reação foi aumentado para 25 volumes, utilizando 13,4 µl de água isenta de nucleases. O programa de PCR consistiu numa desnaturação a 94°C durante 30 segundos, seguida de 35 ciclos de 94°C durante 30 segundos, 55 ou 45°C durante 20 segundos e 72°C durante 30 segundos, com uma etapa final de extensão a 72°C durante 30 segundos. Foram detectados um total de 74 alelos com um número médio de alelos de 7,4 por locus. Um valor médio de Conteúdo de Informação Polimórfica (PIC) de 0,74 mostrou existência de variabilidade entre acessos. Foi também observado um valor médio de diversidade genética de 0,77. A abordagem SSR tem-se revelado uma ferramenta valiosa na determinação da diversidade genética e das relações entre os acessos de D. bulbifera . Estes resultados são significativos no programa de conservação e melhoramento genético desta cultura.