Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics

Abstrato

Evolução epigenética e substituição de histonas: alterações evolutivas em Drosophila H2AvD

Yoshinori Matsuo

As alterações evolutivas nos genes Drosophila H2A e H2AvD, que codificam histonas, foram analisadas utilizando as sequências de 12 Drosophila sp. compreender a evolução da substituição de histonas e da epigenética. O gene Ball, que codifica uma histona treonina quinase, foi localizado lado a lado com o gene H2AvD em sete Drosophila sp. Foi também encontrada uma sequência de ADN fortemente conservada na região a montante do gene H2AvD; esta sequência é provavelmente um sinal transcricional, porque a sequência também foi conservada em quatro outras Drosophila sp. que não tinha um gene Ball upstream. O gene SPARC, que codifica um domínio de ligação ao cálcio, foi localizado cauda a cauda na região a jusante do gene H2AvD em 11 Drosophila sp. estudado. Foi encontrada uma sequência de ADN moderadamente conservada na região do gene H2AvD no local de splicing no primeiro intrão. Foram encontradas diferentes utilizações de códons para os genes H2A e H2AvD para 11 dos 17 aminoácidos, e foram encontradas utilizações de códons característicos de histonas de substituição (H2AvD, H4r, H3.3A e H3.3B) para os aminoácidos. A utilização de códons foi consideravelmente diferente em vários locais de modificação de histonas no gene H2A. Estes resultados sugeriram que, ao contrário dos genes H3.3 e H4r, não só o controlo pós-transcricional, mas também o controlo transcricional desempenharam um papel no gene H2AvD. Para além dos controlos pós-transcricionais, como o splicing e a tradução, o desenvolvimento de um sistema de controlo para a transcrição deve ter ocorrido durante a evolução da substituição de histonas e dos sistemas epigenéticos.