Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics

Abstrato

Alterações Dinâmicas na Composição do Microbioma e Potenciais Funcionais Genómicos na Mastite Bovina

M. Nazmul Hoque, Munawar Sultana, M. Anwar Hossain*

Fornecemos uma mini revisão do estudo anteriormente publicado intitulado “Microbiome Dynamics of Bovine Mastite Progression and Genomic Determinants”, onde relatamos as possíveis alterações dinâmicas nas composições do microbioma favorecidas pelos seus potenciais funcionais genómicos em diferentes estados fisiopatológicos da mastite bovina. Utilizando a abordagem de sequenciação de metagenoma completo (WMS) de ponta, reportamos variações distintas na composição e abundância do microbioma na mastite clínica (CM), mastite clínica recorrente (RCM), mastite subclínica (SCM) e metagenomas do leite saudável (H) ( CM>H>RCM>SCM). As bactérias foram o domínio microbiano predominante (> 99,0% de abundância relativa), seguidas pelas arqueias e pelos vírus. As alterações dinâmicas na composição do bacterioma nos quatro metagenomas foram numericamente dominadas pela inclusão de 67,19% de estirpes oportunistas anteriormente não relatadas nos metagenomas da mastite. Este estudo também relatou a distribuição única e partilhada de microbiomas entre estes metagenomas. Para além da composição e diversidade do microbioma, o estudo reportou a associação de vários genes associados a fatores de virulência (VFGs) e genes resistentes a antibióticos (AGRs) em microbiomas CM, RCM, SCM e H. A anotação funcional detetou diversas vias metabólicas relacionadas com diferentes episódios de mastite. Portanto, os dados publicados revelaram que as alterações na composição do microbioma em diferentes tipos de mastite, a avaliação simultânea de VFGS, ARGs e potenciais funcionais genómicos podem contribuir para desenvolver diagnósticos e terapêuticas baseados no microbioma para a mastite, e têm implicações significativas na redução do impacto económico.