Ivan Vito Ferrari*, Paolo Patrizio
Mycobacterium tuberculosis (Mtb) é o agente causador da tuberculose, que mata 1,8 milhões anualmente. Esta é uma doença infecciosa que geralmente afeta os pulmões, mas também pode afetar outras partes do corpo. A RNA polimerase Mtb (RNAP) é o alvo do medicamento antituberculose de primeira linha Rifampicina (Rif). Relatamos pela primeira vez um medicamento potencial Paritaprevir contra doença infecciosa grave, por abordagem in silico , usando Auto dock Vina e Auto dock 4 (ou MGL Tool), estimado com Pyrx e AM Dock Software, calculando três parâmetros importantes diferentes: Afinidade de ligação (kcal/mol), Ki estimado (em unidades nM) e Eficiência do ligante (LE em kcal/mol). Após uma análise seletiva de mais de 1000 medicamentos, processados com Pyrx (um software de triagem virtual para descoberta computacional de medicamentos) no bolso do sítio de ligação do ligante da proteína (ID PDB 5UHB cadeia C, subunidade beta da RNA polimerase direcionada ao DNA), notamos altos valores desses 3 parâmetros mencionados acima do Paritaprevir, concluindo que ele poderia ser um excelente medicamento candidato para esse tipo de infecção. De fato, a partir dos resultados do Auto dock Vina e Auto dock 4 (ou Auto dock 4.2), implementados com algoritmo genético lamarckiano, LGA, através do AM Dock Software, este medicamento oral, aprovado pelo FDA em 2014, tanto pelo Auto dock Vina quanto pelo Auto dock Vina 4, tem excelente valor de afinidade de ligação, ca. -10,00 kcal/mol, um valor de Ki de 40 nM e eficiência do ligante ca-0,15 kcal/mol. Esses resultados são comparáveis ao medicamento cristalizado na proteína acima mencionada, atualmente usado contra TBC.