Jornal de Patologia Vegetal e Microbiologia

Abstrato

Desenvolvimento de um método de RT-PCR em tempo real para detecção e quantificação rápida do vírus Southern Rice Black-streaked Dwarf em arroz

Songbai Zhang, Deyong Zhang, Yong Liu, Xiangwen Luo, Jue Cheng e Jing Peng

O Southern Rice Black-Streaked Dwarf Virus (SRBSDV) foi uma nova espécie de patógeno no gênero Fijivirus grupo 2, que causou sérias perdas de rendimento de muitas culturas de cereais importantes, como arroz e milho, nos últimos quatro anos (2008-2011), que são importadas na China e no Sudeste Asiático. Notavelmente, não há sintomas típicos no arroz infectado precocemente, o que pode evitar sérias perdas de rendimento. Portanto, é muito importante para a detecção do estágio inicial da infecção do SRBSDV no arroz. Para esse fim, um método de RT-PCR em tempo real foi estabelecido e usado para detectar esse vírus em amostras de arroz, e também foi comparado com o RT-PCR convencional. O resultado mostrou que a RT-PCR em tempo real possuía alta especificidade e sensibilidade para detecção de SRBSDV, e a relação entre valores de Ct e número de cópias de SRBSDV era linear com uma faixa de 4,04×10 ² -4,04×10 ⁷ cópias/reação, e a sensibilidade atingiu 150 cópias/reação. A variabilidade intra e interensaio foi baixa. A RT-PCR em tempo real detectou SRBSDV em 87,5%-100% das amostras de arroz de campo em comparação com 63,6%-100% pela RT-PCR convencional. Como um todo, a RT-PCR em tempo real é um método alternativo valioso para detectar SRBSDV em arroz.