Kwasi Adusei-Fosu e Matthew Dickinson
Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis (FOE), um patógeno que causa a doença da murcha de fusarium em palmeiras de óleo, pode ser detectado usando a reação em cadeia da polimerase (PCR), mas consome muito tempo. A amplificação isotérmica mediada por loop (LAMP) foi usada para detectar rapidamente Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis (FOE) em mudas de palmeiras de óleo. Oito isolados adicionais de Fusarium oxysporum coletados de palmeiras de óleo sintomáticas (ou seja, FOE presumido, pois sua patogenicidade não foi confirmada) e cinco outros isolados não FOE foram amostrados de palmeiras de óleo maduras sintomáticas e tomate, respectivamente, para ampliar o escopo da pesquisa. As identidades de FOE, FOE presumido e não FOE foram estabelecidas por meio de sequenciamento. Os primers LAMP projetados para detectar FOE ou FOE presumido foram baseados em sequências parciais de Secreted in Xylem (SIX8) e citocromo P-450. O tempo de detecção mais precoce para os primers de citocromo SIX8 e P-450 foi de 4:00 min e 6:45 min, respectivamente, com ambos registrando tempo tardio para detecção em 26:30 min. Curvas derivadas de anelamento foram usadas para avaliar o nível de especificidade para ambos os citocromos SIX8 e P-450, mas nenhum dos primers LAMP conseguiu distinguir entre FOE, FOE presumido e não FOE.