Jornal de Pesquisa e Terapêutica Biomolecular

Abstrato

Estudos Conformacionais de [ 11 Ψ 12 (CN 4 )]ScyII e [ 15 Ψ 16 (CN 4 )]ScyII – Dois Análogos da Sciliorhinina II através de Espectroscopia de RMN 2D e Métodos Teóricos

Krzysztof Brzozowski, Emilia Sikorska, Hanna Miecznikowska, Katarzyna Konecko, Rafał Ślusarz, Jolanta Kumirska, Witold Mozga, Jacek Olczak, Janusz Zabrocki, Sylwia Rodziewicz-Motowidło e Zbigniew Kaczyński

Uma análise conformacional de dois análogos da ciliorinina II [11Ψ12(CN4])]ScyII e [15Ψ16(CN4)]ScyII foi realizada em DMSO-d6. Foram aplicadas técnicas de RMN 2D e dinâmica molecular restrita. Os nossos estudos anteriores mostraram que a Scyliorhinin II adota três ligações peptídicas cis em solução de DMSO-d6. Além disso, nos seus dois análogos [Aib16] ScyII e [Sar16] ScyII, também encontrámos geometrias de ligações peptídicas cis. Tendo em conta o que foi dito acima, decidimos realizar extensos estudos conformacionais de análogos restritos da ScyII. Para tal, introduzimos grupos tetrazol em qualquer um dos peptídeos estudados. Estes péptidos foram sintetizados pelo método de fase sólida utilizando a química Fmoc. No caso de dois análogos, foram registados os seguintes espectros: TOCSY, NOESY, ROESY, DQF-COSY e temperatura set. Para obter as estruturas finais, realizámos simulações de dinâmica molecular restrita realizadas utilizando o campo de força CHARMM implementado no programa XPLOR 3.11. Os nossos cálculos resultaram em dois conjuntos de 10 conformações cada. Comparando as estruturas obtidas, verificámos que a introdução de um anel tetrazol substituído em 1,5 influencia a estrutura tridimensional tanto a nível local como global.