Bioenergética: Acesso Aberto

Abstrato

Insights computacionais sobre a inibição competitiva da acetil coenzima A e da succinil coenzima A da primeira etapa do ciclo do ácido cítrico

Salam Pradeep Singh e Bolin Kumar Konwar

O ciclo do ácido cítrico compreende várias reações químicas e é requerido por todos os organismos aeróbios para gerar ATP. A presente investigação centra-se na inibição competitiva da citrato sintase - a primeira etapa do ciclo do ácido cítrico. O substrato natural conhecido da citrato sintase é a acetil Coenzima A. Inicialmente, o primeiro substrato oxaloacetato liga-se à citrato sintase, que induz então a enzima a alterar a sua conformação, criando assim um sítio de ligação para a acetil Coenzima A. Existem também vários relatos de citrato enzima sintase inibida pela succinil coenzima A, que se assemelha à acetil coenzima A e atua como um inibidor competitivo. Assim, a presente investigação trata dos estudos de simulação de acoplamento molecular dos dois substratos, viz. acetil Coenzima A e succinil Coenzima A no sítio ativo da citrato sintase para compreender os insights sobre a inibição competitiva destes dois substratos. Por fim, realizámos também
a análise da teoria do funcional de densidade (DFT) da acetil Coenzima A e da succinil Coenzima A para compreender a carga atómica que pode contribuir para a inibição competitiva. Os escores de acoplamento molecular e energia de interação revelaram acetil Coenzima A a apresentar inibição competitiva com succinil Coenzima A com energia favorável. Além disso, os estudos de DFT revelaram a causa plausível da
inibição competitiva a nível atómico.