Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics

Abstrato

Análise de Complexidade e Entropia da DNA Metiltransferase

Xiaoli Xie, Ying Yu, George Liu, Zhifa Yuan e Jiuzhou Song

Enquadramento: A aplicação da informação de complexidade na sequência de ADN e proteínas em processos biológicos está bem estabelecida neste estudo. As sequências disponíveis para o gene DNMT1 foram exaustivamente exploradas nas complexidades da informação. O gene DNMT1 é uma metiltransferase de manutenção responsável pela cópia dos padrões de metilação do ADN para as cadeias filhas durante a replicação do ADN em diferentes espécies. Resultados: Verificámos que a entropia do gene DNMT1 nas diferentes espécies é dependente da composição em bases do ADN, e a sua complexidade nos mamíferos é menor nos intrões do que nas regiões codificantes. Demonstramos também os impactos da entropia em domínios e não domínio(s) do gene DNMT1. Os resultados das sequências de ADN e de proteínas indicaram que a evolução do ADN tem uma tendência para a complexidade. O mais interessante é que as alterações da metilação do gene ao longo do envelhecimento num modelo único de pinto mostraram características de entropia impulsionadas pelo envelhecimento, o que pode dar uma explicação dos processos de envelhecimento. Conclusão: Em síntese, a complexidade da informação do gene DNMT1 está relacionada com a sua composição genómica, que se associa ao processamento evolutivo e de envelhecimento, embora o mecanismo intrínseco ainda não esteja estudado.