Muhammad Sibte Hasan Mahmood
A utilização de pesticidas e insecticidas aumentou nos campos agrícolas e domésticos, etc., para controlo de pragas, gestão de pragas e para prevenir doenças causadas por insectos, respectivamente, durante um período. Os inseticidas são também uma categoria de pesticidas. Alguns dos pesticidas mais utilizados contêm compostos organofosforados como ingrediente base. Os compostos organofosforados são derivados do éster, amida e tiol do ácido fosfórico. Tais compostos são altamente tóxicos e a sua acumulação no corpo humano pode provocar neuroenvenenamento. Desativam a acetilcolinesterase humana (AChE) e, assim, interrompem a neurotransmissão da acetilcolina. Embora o processo não seja permanente, depende do tempo que demorou a interação entre o composto organofosforado e a AChE antes do início do envelhecimento e da desnaturação da enzima. Antes do envelhecimento da enzima, um grupo de compostos conhecidos como Oximas pertencentes à família das aminas pode ser utilizado para reativar a acetilcolinesterase humana.
As oximas dividem-se em quatro subcategorias, nomeadamente: aldoximas, cetoximas, ésteres de oxima e oximas esteróides, dependendo da sua orientação química. A primeira oxima foi desenvolvida pela República Checa em 1956. Entre estas, a obidoxima e a pralidoxima são utilizadas clinicamente há anos e são sintetizadas comercialmente. As oximas podem reativar a AChE humana removendo o fosfato ligado aos seus resíduos nos lados ativos catalíticos, fosforilados por compostos organofosforados. Neste estudo, as estruturas das oximas foram obtidas a partir de experiências realizadas anteriormente. As estruturas foram depois convertidas em estruturas 2D (SDF) através do PubChem. Os ficheiros SDF foram então convertidos para o formato PDB (3D) utilizando a ferramenta PyRx que produziu uma estrutura terciária das oximas que era um requisito para realizar o acoplamento. Quanto à AChE humana, as estruturas da AChE inibida foram descarregadas do Protein Data Bank no formato PDB e limpas através da ferramenta Chimera. Após a preparação das estruturas 3D, as oximas com maiores probabilidades de reativar a AChE inibida foram selecionadas observando as interações entre a AChE e a oxima. Um total de 67 oximas de diferentes categorias foram selecionadas formando mais de 600 conformações de complexos enzima-ligante. Para melhorar ainda mais as propriedades, as características de toxicidade e metabolismo destas oximas foram também verificadas utilizando o ligplot+ e o Vega ZZ.