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Abstrato
Estudos comparativos e evolutivos de genes e proteínas da pirofosfatase mitocondrial e citoplasmática (PPA)
Roger S Holmes, Kimberly D Spradling-Reeves e Laura A Cox
A pirofosfatase inorgânica (PPA; PPase) (EC: 3.6.1.1) é um membro da família da enzima difosfatase que funciona como uma difosfato hidrolase no citoplasma (PPA1) e nas mitocôndrias (PPA2) dos tecidos dos vertebrados. As sequências e estruturas de aminoácidos PPA1 e PPA2 e as localizações de genes semelhantes a PPA foram examinadas utilizando dados de bioinformática de vários projetos de genomas. Foram também estudados os alinhamentos de sequências e os principais resíduos de aminoácidos conservados (resíduos de PPA2 humano identificados): o péptido sinal mitocondrial (1-31); e resíduos do sítio ativo responsáveis pela ligação do Mg2+ (164Asp, 169Asp e 201Asp), ligação ao substrato (127Arg) e servir como sítio doador de protões (138Tyr). Foram identificadas estruturas 2D e 3D previstas para PPA1 e PPA2 de vertebrados utilizando a estrutura PPA1 de levedura reportada (PDB: 1E9G). Os genes PPA1 e PPA2 de vertebrados continham geralmente 11 ou 12 éxons codificantes, respetivamente, tendo sido observado um éxon 1 alargado e um éxon 3 adicional para os genes PPA2 de vertebrados. Os locais de ligação do fator de transcrição e CpG104 foram identificados no promotor do gene PPA2 humano; e MiR-590 para o PPA2 3'UTR. As análises filogenéticas sugeriram que um gene PPA de invertebrado ancestral sofreu um evento de duplicação genética para formar 2 linhas separadas de evolução genética de vertebrados: PPA1 e PPA2.