Jornal de Pesquisa e Desenvolvimento em Aquicultura

Abstrato

Análise comparativa da diversidade genética na população natural de Labeo rohita e Cirrhinus marigala usando marcadores moleculares específicos da espécie

Faisal Tasleem*, Shahid M, Hina Fatima, Numan Gulzar M

Labeo rohita , comumente conhecido como rohu e Cirrhinus marigala , popularmente conhecido como morakkha são as espécies de peixes economicamente mais importantes e extensivamente cultivadas em todo o subcontinente indiano. A avaliação genética dessas espécies é necessária para sua supervisão adequada, conservação e produção lucrativa. Vários tipos de marcadores moleculares estão disponíveis, mas SSR são os mais importantes devido à sua distribuição igual, abundância no genoma, co-dominância, polimorfismo, detecção de baixo custo e natureza multialélica. Neste estudo, dez amostras de cada espécie foram coletadas de Head Punjnad, Head Muhammad Wala e região de Head Trimmu do rio Chenab, Paquistão. Após a extração do DNA, a amplificação de cinco marcadores de repetição de sequência simples, sua resolução em PAGE e pontuação alélica para os dados genotípicos foram usados ​​para a análise de diferentes índices de diversidade genética com a ajuda do POPGENE versão 1.32, FSTAT versão 2.9.3.2, coeficiente de similaridade de Jaccard e Dice, análise de correspondência simples e programa SIMQUAL do pacote NTSYS-PC.

No caso de Labeo rohita , foram detectados 26 alelos totais com 260 loci, dos quais 189 foram considerados polimórficos. O polimorfismo para os cinco marcadores varia de 43,33% a 96% com valor médio de 72,69%. A frequência alélica varia de 0,2000 a 0,9000 com valor médio de 0,4600, o número de alelos varia de 4,000 a 9,000 com valor médio de 5,2000, a diversidade genética varia de 0,1800 a 8800 com valor médio de 0,6360 e o valor PIC varia de 0,1638 a 0,8680 com valor médio de 0,6012. A diferença genética em pares entre dez amostras coletadas varia de 0,400 a 0,900, enquanto a similaridade genética em pares varia de 0,100 a 1,000. A análise de cluster baseada em UPGMA dividiu dez amostras de Labeo rohita em três clusters e três subclusters. Da mesma forma, cinco marcadores SSR de Cirrhinus marigala mostram 30 alelos com 300 loci em dez amostras com 240 loci polimórficos. O polimorfismo varia de 70% a 96% com valor médio de 80%. A frequência alélica varia de 0,4000 a 0,9000 com valor médio de 0,6600. O número de alelos varia de 4,000 a 9,000 com 6,000 como valor médio. A diversidade genética varia de 0,1800 a 0,7800 com valor médio de 0,4680. O valor PIC varia de 0,1638 a 0,7578 com valor médio de 0,4422. A diferença genética em pares entre dez amostras de Cirrhinus marigala varia de 0,2000 a 0,800 e a similaridade em pares varia de 0,200 a 1,000. A análise de cluster baseada em UPGMA dividiu todas as amostras de Cirrhinus marigala em três clusters e três subclusters. Este estudo revela que o Governo do Paquistão e as agências interessadas devem tomar medidas sérias para melhorar a estrutura genética dessas espécies, especialmente Cirrhinus marigala .