Deputado Xá
Investigámos as comunidades de bactérias oxidantes de amónia (AOB) em lamas ativadas utilizando a reação em cadeia da polimerase (PCR) seguida de polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição terminal (T-RFLP), clonagem e sequenciação da subunidade alfa do gene da monooxigenase de amoníaco ( amoA). Neste estudo, as técnicas de amplificação específica de fragmentos de rDNA 16S do oxidante de amónia por PCR, separação de amostras mistas de PCR por eletroforese em gel de gradiente desnaturante (DGGE) e identificação de bandas por hibridização específica com sondas oligonucleotídicas foram combinadas para permitir a comparação da comunidade composição de múltiplas amostras no espaço e no tempo. As bandas de interesse DGGE foram também excisadas para isolamento de DNA, reamplificação, determinação de sequências e análise filogenética. Comparámos amostras mensais da macrófita emergente Glyceria maxima para determinar os efeitos sazonais que as raízes das plantas e a disponibilidade de oxigénio podem ter nas populações oxidantes de amónia do subgrupo β presentes. Da mesma forma, foram comparadas cinco amostras de solo ou sedimentos, com disponibilidade variada de oxigénio, de diferentes locais. Embora a presença de dois agrupamentos de sequências de Nitrosospira previamente definidos pudesse ser detectada diferencialmente nas amostras examinadas, não houve evidência de um grupo específico que fosse específico para ambientes periodicamente anóxicos.