Revista de Gestão da Zona Costeira

Abstrato

Método SVM-PLS combinado para a previsão de atividades estrogénicas de produtos químicos orgânicos nas águas costeiras

Fei Li, Lulu Cao, Huifeng Wu, Jianmin Zhao

Um conjunto de dados de 517 produtos químicos naturais, sintéticos e ambientais pertencentes a uma vasta gama de classes estruturais foi testado para atividades estrogénicas (expressas como logREC10) no recetor de estrogénio (ER) utilizando um ensaio de dois híbridos de levedura. Neste estudo, as relações quantitativas estrutura-atividade (QSARs) foram determinadas através de dois métodos, os mínimos quadrados parciais (PLS) e a máquina de vetores de suporte (SVM). O Q2 cum do modelo PLS é de 0,678, indicando uma elevada robustez e uma boa capacidade preditiva. O coeficiente de correlação (R) entre os valores observados e previstos é de 0,870, indicando que os valores previstos pelos modelos QSAR finais estavam em boa concordância com os valores experimentais correspondentes. Foram incluídos oito descritores DRAGON no modelo PLS, incluindo Mor03p, L3e, R8p, RTv+ , R8e, R1p+ , R7p+ e HATSv , o que implica que as atividades químicas estrogénicas estão relacionadas com as propriedades atómicas (eletronegatividades atómicas de Sanderson, polarizabilidades e volumes de van der Waals) . A comparação dos resultados obtidos nos dois modelos mostrou que o método SVM apresentou os melhores desempenhos globais, com um erro RMS de 0,145 unidades logREC10 para todo o conjunto. Além disso, foram construídos três modelos lineares QSAR para algumas famílias específicas com base nas suas estruturas químicas. Estes modelos preditivos deverão ser úteis para identificar rapidamente potenciais químicos disruptores endócrinos estrogénicos.